Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vstm2lQ6PDS0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms