Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RgmaQ6PCX7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RgmaQ6PCX7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms