Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Herc4Q6PAV2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Herc4Q6PAV2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms