Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K8

Caskin1, Caskin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin1Q6P9K8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caskin1Q6P9K8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Caskin1Q6P9K8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms