Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp2d40Q6P8N9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2d40Q6P8N9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms