Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpa4Q6P8K8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms