Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
BC061212Q6P8K3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms