Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gga2Q6P5E6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms