Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rcbtb1Q6NXM2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rcbtb1Q6NXM2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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