Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr44Q6NVE8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr44Q6NVE8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms