Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arhgap20Q6IFT4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms