Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms