Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rftn1Q6A0D4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms