Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Sv2cQ69ZS6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Sv2cQ69ZS6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Sv2cQ69ZS6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Sv2cQ69ZS6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sv2cQ69ZS6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms