Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kiaa1549Q68FD9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms