Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CltcQ68FD5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CltcQ68FD5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms