Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nlrp4eQ66X19 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nlrp4eQ66X19 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms