Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2bQ64511 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2bQ64511 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms