Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pan3Q640Q5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Pan3Q640Q5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms