Protein–RNA interactions for Protein: Q640N2

Arl13b, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13bQ640N2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arl13bQ640N2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arl13bQ640N2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms