Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc18Q640L5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc18Q640L5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
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