Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CochQ62507 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CochQ62507 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CochQ62507 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CochQ62507 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CochQ62507 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CochQ62507 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CochQ62507 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CochQ62507 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CochQ62507 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CochQ62507 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CochQ62507 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms