Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga3Q62470 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga3Q62470 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms