Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Supt6hQ62383 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Supt6hQ62383 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Supt6hQ62383 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Supt6hQ62383 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Supt6hQ62383 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Supt6hQ62383 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms