Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sall3Q62255 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms