Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Ttf1Q62187 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ttf1Q62187 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ttf1Q62187 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ttf1Q62187 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ttf1Q62187 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ttf1Q62187 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttf1Q62187 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ttf1Q62187 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ttf1Q62187 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ttf1Q62187 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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