Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ssr4Q62186 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ssr4Q62186 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssr4Q62186 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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