Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sema3bQ62177 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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