Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkd1Q62101 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms