Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Npm1Q61937 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Npm1Q61937 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms