Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Msi1Q61474 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Msi1Q61474 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms