Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PcolceQ61398 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms