Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ift20Q61025 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift20Q61025 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms