Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot7Q60809 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot7Q60809 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms