Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ItgaeQ60677 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ItgaeQ60677 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms