Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xrcc1Q60596 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms