Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Slc5a6Q5U4D8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms