Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rabl6Q5U3K5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rabl6Q5U3K5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms