Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sft2d1Q5SSN7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms