Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Arhgap44Q5SSM3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms