Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Utp18Q5SSI6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms