Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf215Q5SPX3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf215Q5SPX3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms