Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trdv2-2Q5R1A4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms