Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc1Q5NCF2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms