Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trim58Q5NCC9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms