Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnni3kQ5GIG6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms