Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nlrc3Q5DU56 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Nlrc3Q5DU56 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nlrc3Q5DU56 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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