Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc8bQ5DU41 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc8bQ5DU41 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms