Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fam208bQ5DTT3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms