Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf2Q59J78 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf2Q59J78 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms